Με ένα πτυχίο Μικροβιολογίας, υπάρχουν πολλές δυνατότητες, όσον αφορά την επιτυχημένη εύρεση εργασίας. Ένας μικροβιολόγος μπορεί να εργαστεί σε μικροβιολογικά – βιοχημικά εργαστήρια δημοσίων νοσοκομείων, σε μικροβιολογικά – βιοχημικά εργαστήρια ιδιωτικών νοσοκομείων, σε διαγνωστικά και ερευνητικά κέντρα. Επίσης, σε κέντρα υγείας, θεραπευτήρια και κλινικές.

Ένας μικροβιολόγος, τέλος, μπορεί να εργαστεί και σε ασφαλιστικούς οργανισμούς, φαρμακευτικές βιομηχανίες και βιομηχανίες τροφίμων και ποτών.